За осъществяване на конкретни дейности на Фондацията са сформирани и спомагателни ограни, наречени комисии. Създават се и се закриват с решение на УС. Членовете на комисии се назначават и освобождават от УС. Подотчетни са на УС и Председателя. Контролират и ръководят конкретни дейности от дейностите на НС. Заседават поне 1 път на тримесечие.
Фестивална комисия
- определя фолклорните колективи, които да участват в международни фолклорни фестивали в чужбина, по линия на получени покани от ЦИОФФ или други сродни организации, съобразно изискванията на фестивалите-организатори;
- препоръчва чуждестранни фоклорни ансамбли и групи за участие в международни фолклорни фестивали в България;
- организира и координира провеждането на национални прегледи за художествените и технически стойности на фолклорните колективи;
- работи за популяризиране на българското фолклорно богатство.
Състав: Емил Павлов, Стилияна Йоргова, Йоанна Низамска, Жасмина Василева, Даниела Петрова, Стоян Господинов, Милена Ангелова, Фиданка Котева и др.
Културна комисия
- организира и координира усилията си с правителствени и неправителствени организации със сродна дейност при провеждането на културни мероприятия в България и чужбина;
- разработва проекти и кандидатства за външно финансиране пред донорски, дарителски, правителствени и неправителствени фондове и организации;
- работи и представлява фондацията в съвместни инициативи и контакти със сродни правителствени и неправителствени организации в областта на културата, образованието и туризма в България и чужбина.
Състав: Стилияна Йоргова и Йоанна Низамска.
Комисия за PR и реклама
- осъществява връзки с обществеността, медиите и други средства за масово осведомяване;
- работи за популяризиране на дейността и издигане авторитета на Националната секция в публичното пространство и пред обществеността;
- работи за популяризиране на дейността на Националната секция в международен план.
Състав: Цвети Радева, Йоанна Низамска и др.
Младежка комисия
- представлява НС на младежки форуми в България и в чужбина;
- консултира УС по младежки въпроси;
- координира дейността си с други сродни правителствени и неправителствени организации в областта на културата, образованието и туризма в България и чужбина;
- съдейства за популяризиране на идеите на ЦИОФФ сред младежта.
Състав: Йоанна Низамска – Председател, Красин Каракоцев, Даниела Иванова и др.
Финансова комисия
- изготвя годишен бюджет и финансов отчет;
- консултира УС по финансови въпроси.
Състав: Емил Павлов, Силвия Павлова.
Правна комисия
- Състав: Елена Балева, Диана Петкова.